-
Connaître les espèces
- La Bécasse des bois
- La Bernache cravant
- Le Bouquetin des Alpes
- Le Canard Colvert
- Le Castor d’Europe
- Le Cerf élaphe
- Le Cerf muntjac
- Le Cerf sika
- Le Chamois et l’Isard
- Le Chevalier aboyeur
- Le Chevreuil
- Le Courlis cendré
- Le Daim
- Le Faisan commun
- Le Grand Tétras
- La Grive draine
- La Grive litorne
- La Grive mauvis
- La Grive musicienne
- Le Lapin de garenne
- Le Lièvre d’Europe
- Le Loup
- Le Merle noir
- Le Mouflon de Corse
- Le Mouflon méditerranéen
- L’ Oie cendrée
- L’Ours
- La Perdrix grise
- La Perdrix rouge
- Le Raton laveur
- Le Sanglier
- Le Tetras Lyre
- Le Vanneau huppé
- La Sarcelle d’hiver
- Le Vison d’Amérique
- Le Vison d’Europe
- L’Erismature rousse
- Découvrir les habitats
-
Publications et rapports
-
Mammifères
- Ongulés
- Carnivores
- Lagomorphes
- Autres mammifères étudiés (hamster, castor,..)
- Méthodologie
- Articles généraux
-
Oiseaux
- Articles généraux
- Oiseaux d’eau
- Limicoles ( bécasse, bécassines...)
-
Migrateurs terrestres (colombidés, turdidés,...)
- Actes du colloque : Colombidés - connaissance et gestion
- Ecologie de l’Alouette des champs en hiver
- Migrateurs terrestres - Docs téléchargeables
-
Suivi des oiseaux de passage
- Méthodologie générale
- Fonctionnement et analyse des données
- Couverture géographique
- Synthèse météorologique du printemps 2014
- Alouette des champs - Effectifs nicheurs
- Alouette lulu - Effectifs nicheurs
- Perdrix rouge - Effectifs nicheurs
- Faisan de Colchide - Effectifs nicheurs
- Caille des blés - Effectifs nicheurs
- Etourneau sansonnet - Effectifs nicheurs
- Merle noir, Grive musicienne et Grive draine - Effectifs nicheurs
- Grive litorne - Effectifs nicheurs
- Pigeon colombin, Pigeon ramier et Tourterelle turque - Effectifs nicheurs
- Tourterelle des bois - Effectifs nicheurs
- Pie bavarde, Geai des chênes et Corneille noire - Effectifs nicheurs
- Synthèse des tendances des effectifs nicheurs
- Alouette des champs - Effectifs hivernants
- Alouette lulu - Effectifs hivernants
- Vanneau huppé et Pluvier doré - Effectifs hivernants
- Grive mauvis et Grive litorne - Effectifs hivernants
- Grive musicienne et Grive draine - Effectifs hivernants
- Merle noir - Effectifs hivernants
- Etourneau sansonnet - Effectifs hivernants
- Pigeon ramier et Pigeon colombin - Effectifs hivernants
- Tourterelle turque - Effectifs hivernants
- Synthèse des tendances des effectifs hivernants
- Synthèse météorologique décembre 2013 et janvier 2014
- Bibliographie
-
Galliformes
- Galliformes de plaine ( faisans, perdrix, ...)
- Galliformes de montagne (lagopède, tétras, ...)
- Situation des perdrix dans le centre-nord
- Enquête nationale « statut du petit gibier sédentaire de plaine » 2007-2008
- Activités du réseau pour le faisan commun
- Perdrix rouge en région méditerranéenne - Lettre réseau
- Colloque national "Perdrix grise" - Amiens 2009
- Espèces envahissantes et autres oiseaux étudiées
- Identification et comptage des oiseaux d’eau en Afrique
- Habitats de la faune sauvage
- Faune d’Outre mer - Docs téléchargeables
- Suivi sanitaire - Docs téléchargeables
- Relation Homme-Faune sauvage - Docs téléchargeables
- Réserves
- Les ORGFH - Documents téléchargeables
- Enquête sur les prélèvements 1998/1999
-
Mammifères
- Réseaux patrimoniaux
-
Espaces protégés (Réserves)
- L’APB de la Peyroutarié
- La RCFS de Belledonne
- La RCFS de Béniguet
- La RCFS de Corse d’Asco
- La RCFS de Corse de Bavella
- La RCFS de Corse de Tartagine
- La RCFS de Donzère-Mondragon
- La RCFS de la Grand’Mare
- LA RCFS de la Pointe d’Arcay
- La RCFS des Nouvelles Possessions
- La RCFS du Hâble d’Ault
- La RCFS du Rhin
- La RNCFS d’Orlu
- La RNCFS de la Petite Pierre
- La RNCFS des Bauges
- La RNCFS du Caroux-Espinouse
- La RNCFS du Der et des étangs d’Outines et d’Arrigny
- La RNCFS du Golfe du Morbihan
- La RNCFS du lac de Madine et de l’étang de Pannes
- La RNN d’Arès
- La RNN de Jujols
- La RNN de l’Estagnol
- La RNN de l’Etang de la Horre
- La RNN du Grand Connétable
- Les RCFS du Massereau et du Migron
- Les RNN de la Baie de l’Aiguillon
- Observatoire Grande Faune et Habitats - OGFH
- Protocoles de dénombrement
- Outils d’analyse
- Anatidés et Limicoles nicheurs en France : enquêtes 2010
- Appel à projets
- Espèces susceptibles d’être classées nuisibles
- Gestion adaptative

Depuis le 1er janvier, l’Agence française pour la biodiversité et l’Office national de la chasse et de la faune sauvage sont regroupés au sein du nouvel Office français de la biodiversité.
ofb.gouv.fr
Unité sanitaire de la faune
Articles associés
- Actualités PPA
- Actualités sanitaires 2019
- Intoxications d'oiseaux par des semences traitées aux néonicotinoïdes
- Actualités sanitaires 2016
- Actualités sanitaires 2017
- Actualités sanitaires 2018
- Archive 2018 - Actualités PPA
- Cartographie SAGIR
- Contacts SAGIR
- Dossier maladies
- EcophytoPIC - le portail de référence de la protection intégrée des cultures
- Fiche SAGIR
- Film de présentation du réseau SAGIR
- Formations SAGIR pour les ITD et les laboratoires vétérinaires
- Guide SAGIR pour les ITD
- Les lettres SAGIR
- Lettre SAGIR n°187 de janvier 2020
- Mortalité de 200 oiseaux dans le Tarn-et-Garonne
- Partenaires du réseau SAGIR
- Parution du Bilan SAGIR 2009-2010
- Protocole SAGIR
- Rapports SAGIR
- Que faire d'un animal sauvage trouvé mort ou blessé dans la nature ?
- Lettre SAGIR n°180 d'octobre 2014
Problématiques d’études et recherches de l’équipe :
Unité sanitaire de la faune
L’intérêt pour les pathologies de la faune sauvage ne cesse de croître, surtout en raison du nombre de maladies partagées avec les animaux domestiques et de son exposition aux pollutions de l’environnement. Qu’il soit d’ordre environnemental ou cynégétique, l’enjeu patrimonial de ces travaux n’est cependant pas oublié, et la collaboration se développe avec d’autres organismes travaillant sur le même thème.
Il est en effet nécessaire de détecter les agents pathogènes et évaluer leur impact sur la santé des animaux sauvages, en complément des autres facteurs de fluctuation démographique, pour comprendre la dynamique des populations animales et pour ajuster les mesures de gestion de ces espèces lorsque les maladies ou intoxications provoquent des dégâts significatifs. | ![]() |
La première mission de l’Unité sanitaire de la faune relève donc de la surveillance des maladies des oiseaux et des mammifères sauvages. Cette surveillance repose sur deux types de dispositifs. Le premier est représenté par la surveillance événementielle réalisée par le réseau SAGIR, qui s’applique à toutes les espèces d’oiseaux et de mammifères sauvages, pour tout agent pathogène et sur l’ensemble du territoire national, de façon permanente. Le second relève d’études ciblant des couples espèces/pathogènes dans un territoire et sur un pas de temps déterminés.
En fonction des événements détectés, des programmes d’étude et de recherche appliquée en épidémiologie sont développés pour préciser l’importance de la maladie pour l’espèce concernée, comprendre les mécanismes d’apparition, d’entretien et de persistance de la maladie, en lien étroit avec les connaissances relatives aux espèces. Pour certaines maladies intéressantes en termes de conservation, de gestion cynégétique des espèces, de santé publique ou d’économie agricole, les programmes visent également à déterminer les mesures de maîtrise des risques sanitaires les plus adaptées.
S’agissant des pathologies les plus graves (dangers sanitaires de première catégorie transmissibles au bétail et surveillance des effets non intentionnels des produits phyto-pharmaceutiques), un programme d’études ciblées sur les priorités sanitaires a ainsi été défi ni, en application d’une convention-cadre signée avec le MAAF et la FNC.
La mise en oeuvre du programme d’étude et de recherche appliquée conduit par l’Unité sanitaire de la faune repose sur l’expertise combinée des biologistes, des biométriciens, des épidémiologistes, des écotoxicologues et des pathologistes de l’ONCFS, en partenariat avec différentes équipes de recherche françaises et internationales.
Chef de projet USF
Jean-Yves Chollet
Équipe
Anouk Decors, Jean Hars, Célia Lesage, Ariane Payne, Sophie Rossi, Thomas Quintaine, Mickaël Sage.
Partenaires scientifiques
ADILVA, ANSES, Centrum voor Onderzoek in Diergeneeskunde en Agrochemie (Belgique), CIRAD, CNRS, ENV Maisons-Alfort, ENV Toulouse, Friedrich Loeffler Institut (Allemagne), Helmholtz Centre for Environmental Research (Allemagne), Inra, Instituto de Investigación en Recursos Cinegéticos (Espagne), INVS, Istituto Zooprofi lattico Sperimentale Umbria e Marche (Italie), Laboratoires départementaux d’analyses vétérinaires, ONIRIS (ENV Nantes), Plateforme nationale de surveillance épidémiologique en santé animale, PNR de Corse, Station biologique de la Tour du Valat, Université de Reims Champagne-Ardenne, Vet AgroSup Campus vétérinaire de Lyon, Vet-Diagnostics, Veterinary Laboratories Agency Weybridge (Royaume-Uni).
Partenaires financiers
ANSES, Bayer CropScience France, Communauté européenne, Conseil général de la Côte-d’Or, Conseil régional de Bourgogne, FDC de Côte-d’Or, FNC, Groupement de défense sanitaire de la Côte-d’Or, Inra, MEDDE, MAAF.
Partenaires gestionnaires
Cap Ornis, Chasse militaire de Bitche, FDC, FRC et FNC, MEDDE, MAAF, ONF, Parc national des Pyrénées, EPA de Chambord, Groupement de défense contre les maladies animales de l’Indre.
Points forts en 2012
- Synthèse des études épidémiologiques menées sur la tuberculose bovine de la faune sauvage en Côte-d’Or.
- Identification de mollusques hôtes intermédiaires des nématodes agents de la protostrongylose du lièvre.
- Premières investigations sur le foyer de brucellose en Haute-Savoie avec mise en évidence de bouquetins infectés dans le Massif du Bargy.
- Toxicovigilance renforcée du méthiocarbe : bilan de l’étude méthodologique et de modélisation.
- Analyse rétrospective des cas d’intoxications à la Bromadiolone.
- Bilan des études sur la circulation du virus de la fi èvre catarrhale chez les cervidés.
Points forts en 2011
- Démarrage du programme de recherche sur la tuberculose de la faune sauvage en Côte-d’Or. (Expertises dans le domaine de la tuberculose bovine chez le cerf élaphe, le sanglier et le blaireau.)
- Rapport final du programme de recherche sur l’influenza aviaire FRIA.
- Rapport final sur la circulation et impact de la fièvre catarrhale ovine chez les ruminants sauvages en France.
- Implication dans la veille sanitaire d’espèces soumises à un Plan national d’action.
- Rapport d’expertise sur les effets non intentionnels de l’utilisation agricole de l’imidaclopride sur la faune sauvage.
Points forts en 2010
- Audit de la performance du réseau SAGIR en matière d’épidémiosurveillance et d’épidémiovigilance par le Conseil scientifique de l’ONCFS.
- Organisation d’une réunion internationale à Paris sur le programme d’étude et de recherche sur la peste porcine classique du sanglier.
- Expertises dans le domaine de la tuberculose bovine chez le cerf élaphe, le sanglier et le blaireau.
Points forts en 2009
- Opérations nationales de toxicovigilance.
- Tests d’exposition aux molluscicides de perdrix grises en conditions semi-naturelles.
- Représentation française à la réunion européenne sur la surveillance sanitaire de la faune sauvage à Bruxelles le 15 octobre 2009.
- Renforcement de l’animation du réseau SAGIR (22 réunions départementales en 2009).
Exemples d’études et recherche
Tuberculose de la faune sauvage en Côte-d’Or : état des lieux
Surveillance de la brucellose en Haute-Savoie
Études récentes sur la peste porcine classique (PPC) du sanglier dans les Vosges du Nord
Toxicovigilance sur les semis de maïs
La faune sauvage peut-elle être un réservoir de tuberculose bovine en France ?
La fièvre catarrhale ovine atteint-elle les ruminants sauvages ?
Mise à jour le 16/07/2013